Martin H. Rathke (rojen 25. avgusta 1793, Danzig, Prusija [zdaj Gdańsk, Pol.] - umrl 3. septembra 1860, Königsberg [zdaj Kaliningrad, Rusija]), nemški anatom, ki je prvi opisal škrlatne reže in škrlatni loki v zarodkih sesalcev in ptic. Leta 1839 je prvič opisal tudi embrionalno strukturo, danes znano kot Rathkejevo vrečko, iz katere se razvije zadnji del režnja hipofize.
Rathke je končal desetletno medicinsko prakso v rodnem kraju, ko je postal profesor fiziologije na univerzi v Dorpatu in pozneje (1835) profesor zoologije in anatomije v Königsbergu. Izjemna embriologinja je Rathke menila, da so škrlatni loki ostanki škržnih prednikov, vendar je tudi njihov pomen prepoznal v poznejšem razvoju krvnih žil. Rathke je tudi pionirsko raziskovala morsko zoologijo. Leta 1855 je bil izvoljen za rojaka Kraljevega društva.
