Moldavija je razglasila neodvisnost med prvo svetovno vojno. V različnih obdobjih prejšnjih stoletij je bila del Moldavije, Rusije, Otomanskega cesarstva in Romunije, njeni simboli pa izhajajo iz zgodovinskih in kulturnih povezav z Moldavijo in Romunijo. Njegova zastava decembra 1917 je bila tradicionalna romunska trobojnica modre, rumene in rdeče v vodoravni obliki. V središču je bila glava auroka, izumrlega evropskega vola. Ta zastava je letela le na kratko, ker je bila Moldavija aprila 1918 vključena v Romunijo. Sovjetska zveza je Moldavijo pridobila leta 1940, po nemški in romunski okupaciji leta 1944 pa je bila Moldavijska sovjetska socialistična republika ponovno vzpostavljena. Njegova značilna zastava, sprejeta leta 1952, je dodala zeleno vodoravno črto skozi središče sovjetskega Rdečega transparenta. Green naj bi se nanašal na vinogradništvo in druge kmetijske dejavnosti na tem območju.
Do leta 1989 je bila v Moldaviji močna agitacija proti komunistični vladavini in modro-rumeno-rdeča romunska trobojnica je postala priljubljen simbol. Uradno je nadomestila komunistično zastavo maja 1990. Novi grb Moldavije, zasnovan na tradicionalnih vzorcih, je bil dodan 3. novembra istega leta: Na prsih orla je ščit z aurochovo glavo, obdan z polmesecem, zvezda in cvet. Orel je tradicionalni emblem romunskega ozemlja Valachia, v svojih talonah ima žezlo in oljčno vejo ter križ v kljunu. Rdeča, modra in zlata barva ščita odraža nacionalno trobojnico. Zastava je ostala neodvisna po neodvisnosti Moldavije leta 1991.
