Kot del skrbniškega ozemlja Tihih otokov (TTPI), ki ga upravljajo ZDA, je bil Palau pod zastavami Združenih narodov, ZDA in skrbniškega ozemlja. Lokalna želja po ločeni državi in vladi se je uresničila 1. januarja 1981, ob tej priložnosti pa je bila dvignjena palavska zastava. Leta 1979 je bilo razpisano natečaj, na katerem je bilo več kot tisoč predlogov; enega izbranega je ustvaril Blau Skebong, nova vlada pa ga je odobrila 22. oktobra 1980. Ta zastava je v uporabi še danes.
Zlati disk predstavlja luno, ki ima za palavsko kulturo poseben pomen. Polna luna tradicionalno velja za najboljši čas za ribolov, sajenje in druge dejavnosti. Tam naj bi ljudem dal občutek topline, spokojnosti, miru, ljubezni in domače enotnosti. Ozadje zastave ni, kot je mogoče pričakovati, simbol Tihega oceana; raje se nanaša na "končni prehod tujega organa upravljanja z naše dežele." Popolne neodvisnosti Palau ni dosegel šele oktobra 1994, vendar v zastavi takrat niso bile spremenjene. Prvotna zastava iz leta 1981 je ohranjena v muzeju Palau v glavnem mestu Koror. Zastava Palauana je po zasnovi podobna zastavi Bangladeša, vendar imata obe barvi in simboliki.
