Konformacija, katera koli od neskončnega števila možnih prostorskih razporeditev atomov v molekuli, ki so posledica vrtenja njenih sestavnih skupin atomov okoli enojnih vezi.
beljakovine: Konformacija proteinov v vmesnikih
Tako kot mnoge druge snovi tako s hidrofilnimi kot hidrofobnimi skupinami se tudi topni proteini migrirajo v vmesnik med zrakom
Za vsako molekulo, v kateri ena kovalentna vez povezuje dve poliatomski skupini, so možne različne konformacije, v katerih vsaj en atom ne leži vzdolž osi zadevne posamezne vezi. Najpreprostejša takšna molekula je vodikova peroksida, v kateri se lahko dve hidroksilni skupini med seboj vrtita okoli osi kisikovo-kisikove vezi. Prisotnost več kot ene takšne enojne vezi v molekuli, kot da propana (CH 3 CH 2 CH 3), na primer, samo prispeva k zapletenosti položaja, ne da bi spremenili njihovo naravo. V molekulah, kot so tiste cianogena (N≡C ― C≡N) ali butadijna (H ― C≡C ― C≡C ― H), vsi atomi ležijo vzdolž osi osrednje enojne vezi, tako da ne obstajajo razločljive konformacije obstajajo.
Na splošno vsaka razlikovalna konformacija molekule predstavlja stanje različne potencialne energije zaradi delovanja privlačnih ali odbojnih sil, ki se razlikujejo glede na razdalje med različnimi deli strukture. Če te sile ne bi bile, bi vse konformacije imele enako energijo, vrtenje okoli enojne vezi pa bi bilo popolnoma prosto ali neomejeno. Če so sile močne, se različne konformacije močno razlikujejo po energiji ali stabilnosti: molekula bo običajno zasedla stabilno stanje (eno z nizko energijo) in prešlo v drugo stabilno stanje šele, ko absorbira dovolj energije, da doseže in preide skozi nestabilno intervenirajoče stanje konformacija.
Na primer, intramolekularne sile v etanu so tako šibke, da je mogoče sklepati le o njihovih subtilnih učinkih na termodinamične lastnosti, kot sta entalpija in entropija. (Tudi če je bila notranja rotacija v etanu močno omejena, so njegove tri najbolj stabilne konformacije nerazločljive.) Molekularne strukture nekaterih kompleksnejših spojin pa postavljajo tako močne ovire za vrtenje, da so stereoizomerne oblike, ki se razlikujejo le po konformaciji, dovolj stabilne, da biti izoliran.
