Razvrstitev po „naravnih znakih“
Linnaeus ni menil, da je spolni sistem njegov glavni prispevek k "reformaciji botanike", h kateri je težil. Njegov glavni prispevek je bil v obliki knjižice Fundamenta Botanica (1736; "Temelji botanike"), ki je oblikovala načela in pravila, ki jih je treba upoštevati pri razvrščanju in poimenovanju rastlin.
Leta 1735 se je Linnaeus srečal z Boerhaaveom, ki je Linnaeusa predstavil Georgeu Cliffordu, lokalnemu angleškemu trgovcu in bankirju, ki je bil tesno povezan z nizozemsko družbo Vzhodne Indije. Navdušen nad Linnaeusovim znanjem je Clifford ponudil Linnaeusu mesto kustosa svojega botaničnega vrta. Linnaeus je sprejel stališče in to priložnost izkoristil za razširitev nekaterih poglavij Fundamenta Botanica v ločenih publikacijah: Bibliotheca Botanica (1736; „Knjižnica botanike“); Critica Botanica (1737; "Kritika botanike") o botanični nomenklaturi; in Razredi Plantarum (1738; "Razredi rastlin"). Teoretični okvir iz teh knjig je uporabil v dveh nadaljnjih publikacijah: Hortus Cliffortianus (1737), katalog vrst, ki jih vsebuje Cliffordova zbirka; in Genera Plantarum (1737; "Genera of Plants"), ki sta spremenila in posodobila definicije rastlinskih rodov, ki jih je prvi ponudil Tournefort.
Linnaeus je generacijo Plantarum smatral za njegov kronati taksonomski dosežek. V nasprotju s prejšnjimi poskusi drugih botanikov generične opredelitve, ki jih je nadaljeval niz samovoljnih delitev, je Genera Plantarum predstavila sistem, ki temelji na tem, kar je Linnaeus imenoval "naravni znaki" rodov - morfološke opise vseh delov cvetov in plodov. V nasprotju s sistemi, ki temeljijo na samovoljnih delitvah (vključno z njegovim spolnim sistemom), bi sistem, ki temelji na naravnih znakih, lahko sprejel vse večje število novih vrst - ki imajo pogosto različne morfološke značilnosti - ki se v Evropo izlivajo s svojih čezmorskih trgovskih mest in kolonij.
Razlikovanje Linnaeusa med umetno in naravno klasifikacijo organizmov pa je postavilo vprašanje mehanizma, ki je omogočil, da organizmi spadajo v naravno hierarhijo. Na to vprašanje je lahko odgovoril le glede vrst: vrste, po Linnaeusu, so bile po obliki podobne, ker izvirajo iz istega starševskega para, ki ga je ustvaril Bog na začetku sveta. Mnogi njegovi sodobniki so si delili podoben koncept vrst. Eden takšnih osebnosti je bil francoski naravoslovec Georges-Louis Leclerc de Buffon, ki se je takrat ukvarjal s podobnim vseobsegajočim naravoslovnim projektom - čeprav je Buffon dvomil v obstoj naravnih rodov, redov ali razredov. Linnaeus je skušal razložiti obstoj teh delitev v okviru hibridizacije; vendar vprašanje naravnih hierarhij ne bi dobilo zadovoljivega odgovora, dokler angleški naravoslovec Charles Darwin podobnosti ni razložil s skupnim potomstvom v svojem izvoru vrst (1859).
![Orkan Katrina nevihta [2005]](https://images.thetopknowledge.com/img/world-history/3/hurricane-katrina-storm-2005.jpg "Orkan Katrina nevihta [2005]")