Osvobodilni boj v Tanganjiki je vodila Afriška nacionalna zveza Tanganyika, katere zastava je bila vodoravna trobojnica zeleno-črno-zelene barve. Volitve so potrdile ogromno podporo javnosti za organizacijo, britanske oblasti pa so predlagale, da se partijska zastava spremeni kot državno zastavo po neodvisnosti 9. decembra 1961. Takrat so bila dodana rumena fimibriranja.
Pod arabsko vladavino je Zanzibar že dolgo planil rdečo zastavo, vendar je 12. januarja 1964 na oblast prišel črni afriški režim pod zastavo črne, rumene in modre barve. Naslednji mesec je vladajoča Afro-Shirazi stranka uvedla novo državno zastavo, podobno svoji. Vodoravne modro-črno-zelene črte so stale morje, ljudi in kopno, ozka bela navpična črta pa je bila za mir.
Aprila 1964 sta se državi Tanganyika in Zanzibar združili, v začetku julija pa sta bili zastavljeni tradiciji zastav, da bi ustvarili novo državno zastavo Tanzanije. Barve zastav so bile za prepoznavnost vključene diagonalno. Večinsko prebivalstvo države simbolizira črna črta, zelena pa nakazuje na bogate kmetijske vire zemlje. Mineralno bogastvo se odraža v ozkih rumenih mejah, Indijski ocean pa simbolizira modrino. Po združitvi Zanzibarja s Tanganjiko je zastava Zanzibar kljub temu še naprej uporabljala lokalno na teh otokih.
